Το ιόν του φθορίου είναι ένα κρίσιμο στοιχείο στην ανθρώπινη διατροφή.
Βρίσκεται κυρίως στα οστά και τα δόντια, λόγω του μεγάλου συγγένειας με το φωσφορικό ασβέστιο, και περίπου το 99% του φθορίου που υπάρχει στον οργανισμό βρίσκεται στους σκληρούς ιστούς. Για την πρόληψη των ελλείψεων φθορίου, διάφορες χώρες χρησιμοποιούν φθορίωση του νερού. Η ενσωμάτωση του 0,7-1,2mg/L φθορίου στο πόσιμο νερό έχει προωθήσει μείωση της τερηδόνας έως και 50%.
Ωστόσο, η φθορίωση του νερού συζητείται πολύ, λόγω της πιθανής βλάβης στην υγεία του πληθυσμού.
Υψηλότερες συγκεντρώσεις μπορεί να προκαλέσουν βλάβες στο σκελετικό σύστημα (σκελετική φθορίαση), παρέμβαση στη λειτουργία των νεφρών και να επηρεάσει τη μάθηση και τη μνήμη. Το νερό είναι το κυριότερη πηγή πρόσληψης φθορίου για έναν ενήλικα, επειδή τα περισσότερα τρόφιμα είναι χαμηλά σε φθόριο, με εξαίρεση τα θαλάσσια ψάρια, τα μύδια, ο αστακός, το καβούρι, οι γαρίδες και ορισμένα τσάγια.
Η απορρόφηση του φθορίου από τα τρόφιμα είναι περίπου 50-80% σε σύγκριση με την ουσιαστικά πλήρη απορρόφηση από πόσιμο νερό.
Το διαιτητικό φθόριο που λαμβάνεται από τα τρόφιμα και νερό απορροφάται αποτελεσματικά τόσο από το στομάχι όσο και από το λεπτό έντερο χωρίς ρύθμιση- έτσι, εάν προσλαμβάνεται σε μεγάλες ποσότητες, ο οργανισμός υποβάλλεται σε δηλητηρίαση από φθόριο.